در پایان لیگ نوزدهم محمدحسین مرادمند به عنوان یکی از بازیکنان تاثیرگذار فصول گذشته لیگ برتر در آستانه ۲۸ سالگی و در اوج پختگی پای میز مذاکره با مدیران استقلال نشست و با احمد سعادتمند مدیرعامل وقت آبی‌ها قراردادی ۲ ساله امضا کرد. او دیگر آن بازیکن ناشناس آکادمی و تیم بزرگسالان سپاهان نبود که با ناراحتی به مشهد رفته بود. حالا دیگر نگاه تیم‌های دیگری از جمله سپاهان دنبال او بود ولی مرادمند استقثلال را انتخاب کرد.
لیگ بیستم؛ ۳۳ مسابقه و ۳ گل
وقتی محمدحسین مرادمند به عنوان یکی از ستاره‌های شهرخودرو به استقلال پیوست، محمود فکری در تصمیمی عجیب هدایت آبی‌پوشان را برعهده گرفت. احتمالا همه هواداران استقلال با جزییات حواشی لیگ بیستم را در ذهن دارند؛ از عدم اعتماد به محمود فکری از سوی هواداران تا ادعای کم‌کاری برخی بازیکنان نظیر سیاوش یزدانی و درنهایت حضور فرهاد مجیدی. این فصل برای استقلال درنهایت با کسب رتبه سومی به اتمام رسید. محمدحسین مرادمند در اولین سال حضورش اما عملکرد خوبی داشت. او در ۳۳ مسابقه لیگ برتر، جام حذفی و لیگ قهرمانان آسیا چیزی نزدیک به ۲۸۰۰ دقیقه برای آبی‌پوشان بازی کرد و ۲ مرتبه هم گلزنی کرد تا هواداران استقلال از عملکردش راضی باشند.
لیگ بیست‌ویکم؛ کابوس خدمت سربازی
در لیگ بیست‌ویکم استقلال با فرهاد مجیدی وارد رقابت‌های لیگ برتر شد و در پایان بدون اینکه شکست را تجربه کند، عنوان قهرمانی لیگ برتر یا به اصطلاح جام طلایی را از آن خود کرد. یکی از بازیکنان کلیدی فرهاد مجیدی در شروع رقابت‌ها محمدحسین مرادمند بود که عملکردی بی‌نقص در نیم‌فصل اول ارائه کرد اما خدمت سربازی از راه رسید و نگرانی درباره ادامه عملکرد منسجم خط دفاعی استقلال با جدایی اجباری سیاوش یزدانی و محمدحسین مرادمند ایجاد شد. این دو به هر ترتیب عازم ملوان شدند اما با اضافه شدن رافائل سیلوا، خط دفاعی استقلال استحکام خود را حفظ کرد تا دیگر کسی در پایان فصل از جدایی این دو بازیکن و ضرری که می‌توانست به استقلال بزند، چیزی نگوید و ننویسد. مرادمند در این فصل ۱۶ مسابقه به مدت ۱۴۷۰ دقیقه با پیراهن استقلال بازی کرد اما حسرت جدایی غیرمنتظره، آن هم در اوج آمادگی هیچ‌گاه از دل و ذهن او پاک نخواهد شد.
لیگ بیست‌ودوم؛ آغاز مصدومیت‌ها با سا پینتو
در لیگ بیست‌ودوم ریکاردو سا پینتو به عنوان جانشین فرهاد مجیدی انتخاب شد و در پایان استقلالی‌ها فصل را با کسب رتبه سومی تمام کردند. محمدحسین مرادمند اما فصل کابوس‌واری را پشت سر گذاشت. مصدومیت‌های متوالی این مدافع اصفهانی از لیگ بیست‌ودوم آغاز شد و او تنها ۱۱ مرتبه (۷۹۴ دقیقه) فرصت بازی با پیراهن استقلال را پیدا کرد. با این حال ثبت ۳ گل در این ۱۱ مسابقه باعث شد تا اعتماد هواداران به او همچنان حفظ شود. جالب اینکه آخرین گل مرادمند در این فصل مقابل پرسپولیس در فینال جام حذفی و در آخرین حضور سا پینتو به عنوان سرمربی استقلال به ثمر رسید که البته ثمری در پی نداشت و در ادامه گل امید عالیشاه باعث قهرمانی سرخ‌ها با یحیی گل‌محمدی شد.
لیگ بیست‌وسوم؛ ادامه سریال مصدومیت‌ها
جواد نکونام سرمربی جدید استقلال برای حضور در لیگ بیست‌وسوم بود. این فصل در پایان با نایب قهرمانی استقلال تمام شد. محمدحسین مرادمند در این فصل باز هم یکی از بازیکنان آماده استقلال در شروع فصل بود و به عنوان یار ثابت وارد مسابقات می‌شد. در ادامه اما او باز هم بخش مهمی از فصل را به دلیل مصدومیت از دست داد تا فقط در ۱۷ مسابقه لیگ برتر و جام حذفی فرصت بازی پیدا کند. مرادمند البته باز هم شم گلزنی بالای خود را به نمایش گذاشت و ۲ گل در این مسابقات زد تا حضورش در اردوی آبی‌ها با امیدواری به اینکه دیگر مصدوم نمی‌شود، ادامه‌دار بشود.
لیگ بیست‌وچهارم؛ ادامه مصدومیت و خط پایان
ماجرا در لیگ بیست‌وچهارم نسبت به دو فصل گذشته برای محمدحسین مرادمند تغییری نکرد. او به مانند فصل گذشته بخش مهمی از فصل را به دلیل مصدومیت‌های مختلف از دست داد تا فقط در ۲۱ مسابقه برای استقلال به مدت ۱۵۰۰ دقیقه بازی کند. این عملکرد محمدحسین مرادمند در فصلی که استقلال یکی از بدترین عملکردهای تاریخ خود را ثبت کرد، سبب شد تا وسواس هوادارن نسبت به نمایش مرادمند هم بیشتر شود و آن‌ها در طول مسابقات بارها وضعیت فیزیکی مرادمند و سایر بازیکنان‌شان را به باد انتقاد گرفتند و حتی گاهی مسخره می‌کردند.
در این شرایط مشخص بود که مرادمند در ۳۲ سالگی کار سختی برای ادامه حضور در استقلال دارد و درنهایت هم چنین اتفاقی رخ نداد. قرارداد این بازیکن در پایان لیگ بیست‌وچهارم به اتمام رسید و هیچ‌کس در باشگاه و هواداران خواهان ادامه همکاری با مرادمند نشد. او اگرچه در ۲ فصل ابتدایی عملکرد خوبی در استقلال داشت اما فرا رسیدن خدمت سربازی و سپس مصدومیت‌ها سبب شد تا این بازیکن در حالی مجبور به ترک استقلال شود که دل کسی برای او تنگ نمی‌شود.
